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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Semiárido. |
Data corrente: |
12/06/2023 |
Data da última atualização: |
12/06/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
RAMOS, C. P.; DORNELES, E. M. S.; HAAS, D. J.; VESCHI, J. L. A.; LOUREIRO, D.; PORTELA, R. D.; AZEVEDO, V.; HEINEMANN, M. B.; LAGE, A. P. |
Afiliação: |
CAROLINA PANTUZZA RAMOS, UFMG; ELAINE MARIA SELES DORNELES, UFLA; DIONEI JOAQUIM HAAS, UFMG; JOSIR LAINE APARECIDA VESCHI, CPATSA; DAN LOUREIRO, UFBA; RICARDO DIAS PORTELA, UFBA; VASCO AZEVEDO, UFMG; MARCOS BRYAN HEINEMANN, USP - São Paulo; ANDREY PEREIRA LAGE, UFMG. |
Título: |
Molecular characterization of Corynebacterium pseudotuberculosis, C. silvaticum, and C. auriscanis by ERIC-PCR. |
Ano de publicação: |
2022 |
Fonte/Imprenta: |
Ciência Rural, v. 52, n. 11, e20210328, 2022. |
DOI: |
http://doi.org/10.1590/0103-8478cr20210328 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The aims of the present study were (i) to genotype Corynebacterium pseudotuberculosis, C. silvaticum, and C. auriscanis strains using enterobacterial repetitive intergenic consensus (ERIC-PCR), and (ii) to analyze the epidemiological relationships among isolates according to biovar (Equi and Ovis), species, host, and geographical origin of the C. pseudotuberculosis strains. Sixty-eight C. pseudotuberculosis, nine C. silvaticum, and one C. auriscanis, C. pseudotuberculosis ATCC® 19410? strain and the attenuated C. pseudotuberculosis 1002 vaccinal strain were fingerprinted by ERIC 1+2-PCR. Field strains were isolated from various hosts (cattle, buffaloes, sheep, goats, horses, dogs, and pigs) in six countries (Mexico, Portugal, Brazil, Equatorial Guinea, Egypt, and Israel). High genetic diversity was found among the studied Corynebacterium spp. isolates, clustering in 24 genotypes with a Hunter & Gaston diversity index (HGDI) of 0.937. The minimal spanning tree of Corynebacterium spp. revealed three clonal complexes, each associated with one bacterial species. Twenty-two genotypes were observed among C. pseudotuberculosis isolates, with an HGDI of 0.934. Three major clonal complexes were formed at the minimal spanning tree, grouped around the geographic origin of C. pseudotuberculosis isolates. These results reinforce the high typeability, epidemiological concordance, and discriminatory power of ERIC-PCR as a consistent genotyping method for C. pseudotuberculosis, which could be useful as an epidemiological tool to control caseous lymphadenitis. Moreover, our results also indicate the potential of ERIC 1+2-PCR for the genotyping of other species of Corynebacterium other than C. pseudotuberculosis. MenosThe aims of the present study were (i) to genotype Corynebacterium pseudotuberculosis, C. silvaticum, and C. auriscanis strains using enterobacterial repetitive intergenic consensus (ERIC-PCR), and (ii) to analyze the epidemiological relationships among isolates according to biovar (Equi and Ovis), species, host, and geographical origin of the C. pseudotuberculosis strains. Sixty-eight C. pseudotuberculosis, nine C. silvaticum, and one C. auriscanis, C. pseudotuberculosis ATCC® 19410? strain and the attenuated C. pseudotuberculosis 1002 vaccinal strain were fingerprinted by ERIC 1+2-PCR. Field strains were isolated from various hosts (cattle, buffaloes, sheep, goats, horses, dogs, and pigs) in six countries (Mexico, Portugal, Brazil, Equatorial Guinea, Egypt, and Israel). High genetic diversity was found among the studied Corynebacterium spp. isolates, clustering in 24 genotypes with a Hunter & Gaston diversity index (HGDI) of 0.937. The minimal spanning tree of Corynebacterium spp. revealed three clonal complexes, each associated with one bacterial species. Twenty-two genotypes were observed among C. pseudotuberculosis isolates, with an HGDI of 0.934. Three major clonal complexes were formed at the minimal spanning tree, grouped around the geographic origin of C. pseudotuberculosis isolates. These results reinforce the high typeability, epidemiological concordance, and discriminatory power of ERIC-PCR as a consistent genotyping method for C. pseudotuberculosis, which could ... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Epidemiologia molecular; ERIC 1+2-PCR; Genotipagem. |
Thesagro: |
Doença Animal; Linfadenite Caseosa. |
Thesaurus Nal: |
Caseous lymphadenitis; Genotyping; Molecular epidemiology. |
Categoria do assunto: |
L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1154376/1/Molecular-characterization-of-Corynebacterium-pseudotuberculosis-2022.pdf
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Marc: |
LEADER 02705naa a2200325 a 4500 001 2154376 005 2023-06-12 008 2022 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttp://doi.org/10.1590/0103-8478cr20210328$2DOI 100 1 $aRAMOS, C. P. 245 $aMolecular characterization of Corynebacterium pseudotuberculosis, C. silvaticum, and C. auriscanis by ERIC-PCR.$h[electronic resource] 260 $c2022 520 $aThe aims of the present study were (i) to genotype Corynebacterium pseudotuberculosis, C. silvaticum, and C. auriscanis strains using enterobacterial repetitive intergenic consensus (ERIC-PCR), and (ii) to analyze the epidemiological relationships among isolates according to biovar (Equi and Ovis), species, host, and geographical origin of the C. pseudotuberculosis strains. Sixty-eight C. pseudotuberculosis, nine C. silvaticum, and one C. auriscanis, C. pseudotuberculosis ATCC® 19410? strain and the attenuated C. pseudotuberculosis 1002 vaccinal strain were fingerprinted by ERIC 1+2-PCR. Field strains were isolated from various hosts (cattle, buffaloes, sheep, goats, horses, dogs, and pigs) in six countries (Mexico, Portugal, Brazil, Equatorial Guinea, Egypt, and Israel). High genetic diversity was found among the studied Corynebacterium spp. isolates, clustering in 24 genotypes with a Hunter & Gaston diversity index (HGDI) of 0.937. The minimal spanning tree of Corynebacterium spp. revealed three clonal complexes, each associated with one bacterial species. Twenty-two genotypes were observed among C. pseudotuberculosis isolates, with an HGDI of 0.934. Three major clonal complexes were formed at the minimal spanning tree, grouped around the geographic origin of C. pseudotuberculosis isolates. These results reinforce the high typeability, epidemiological concordance, and discriminatory power of ERIC-PCR as a consistent genotyping method for C. pseudotuberculosis, which could be useful as an epidemiological tool to control caseous lymphadenitis. Moreover, our results also indicate the potential of ERIC 1+2-PCR for the genotyping of other species of Corynebacterium other than C. pseudotuberculosis. 650 $aCaseous lymphadenitis 650 $aGenotyping 650 $aMolecular epidemiology 650 $aDoença Animal 650 $aLinfadenite Caseosa 653 $aEpidemiologia molecular 653 $aERIC 1+2-PCR 653 $aGenotipagem 700 1 $aDORNELES, E. M. S. 700 1 $aHAAS, D. J. 700 1 $aVESCHI, J. L. A. 700 1 $aLOUREIRO, D. 700 1 $aPORTELA, R. D. 700 1 $aAZEVEDO, V. 700 1 $aHEINEMANN, M. B. 700 1 $aLAGE, A. P. 773 $tCiência Rural$gv. 52, n. 11, e20210328, 2022.
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Registro original: |
Embrapa Semiárido (CPATSA) |
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Registros recuperados : 12 | |
1. | | TRITSCH, I.; SIST, P.; NARVAES, I. da S.; FREITAS, L. J. M. de; BLANC, L.; BOURGOIN, C.; CORNU, G.; GOND, V. Multiple patterns of forest disturbance and logging shape forest landscapes in Paragominas, Brazil. Forests, v. 7, n. 12, 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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2. | | GOERGEN, Ç L. C. de G.; KILCA, R. de V.; NARVAES, I. da S.; SILVA, M. N.; SILVA, E. A.; PEREIRA, R. S. P.; ADAMI, M. Distinção de espécies de eucalipto de diferentes idades por meio de imagens TM/Landsat 5. Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 51, n. 1, p. 53-60, jan. 2016 Título em inglês: Distinction of eucalyptus species of different ages using Landsat 5 TM images.Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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3. | | NARVAES, I. da S.; PORRO, R.; CORDEIRO, T. F.; ELLERES, F. A. P.; SAMPAIO, S. M. N.; WATRIN, O. dos S. Efetividade de uma iniciativa de manejo para contenção da exploração florestal ilegal em um Projeto de Desenvolvimento Sustentável em Anapu, Pará. Boletim do Museu Paraense Emílio Goeldi. Ciências Naturais, v. 16, n. 1, p. 97-114, 2021.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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4. | | OLIVEIRA, A. H. M.; ADAMI, M.; GOMES, A. R.; AMARAL, S.; MARTORANO, L. G.; NARVAES, I. da S.; BARROS, M. N. R.; MACIEL, M. de N. M. Vulnerabilidade e integridade de padrões de uso e cobertura da terra na Área de Endemismo Tapajós entre 2004 a 2012. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE SENSORIAMENTO REMOTO, 18., 2017, Santos. Anais... São José dos Campos: INPE, 2017. p. 5111-5118.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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5. | | OLIVIERA, A. H. M.; ADAMI, M.; GOMES, A. R.; AMARAL, S.; MARTORANO, L. G.; NARVAES, I. da S.; BARROS, M. N. R.; MACIEL, M. de N. M. Vulnerabilidade e integridade de padrões de uso e cobertura da terra na área de endemismo do Tapajós entre 2004 a 2012. In: VASCONCELOS, S. S.; RUIVO, M. de L. P.; LIMA, A. M. M. de (Org.). Amazônia em tempo: impactos do uso da terra em diferentes escalas. Belém, PA: Universidade Federal do Pará: Museu Paraense Emílio Goeldi: Embrapa Amazônia Oriental, 2017. p. 57-74.Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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6. | | SILVA, M. G. L. da; CORDEIRO, T. F.; OLIVEIRA, R. R. S. de; NARVAES, I. da S.; GOMES, A. R.; ADAMI, M.; FREITAS, L. J. M. de; VALERIANO, D. de M. Índice texturais das áreas de exploração florestal na FLONA do Tapajós (Pará), utilizando imagens de média resolução espacial fusionadas. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE SENSORIAMENTO REMOTO, 18., 2017, Santos. Anais... São José dos Campos: INPE, 2017. p. 3962-3969.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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7. | | OLIVEIRA, R. R. S. de; SILVA, M. G. L. da; NARVAES, I. da S.; CORDEIRO, T. F.; VALERIANO, D. M.; GOMES, A. R.; ADAMI, M.; FREITAS, L. J. M. de. Detecção de padrões espaciais ligados à exploração florestal madeireira na Amazônia Legal: o caso da COOMFLONA, na Floresta Nacional do Tapajós. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE SENSORIAMENTO REMOTO, 18., 2017, Santos. Anais... São José dos Campos: INPE, 2017. p. 2216-2223.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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8. | | LIMA, I. V. de; SILVA, M. B. da; ADAMI, M.; PINHEIRO, A. F.; BARROS, M. N. R.; NARVAES, I. da S.; GOMES, A. R.; WATRIN, O. dos S.; MAGNO JÚNIOR, P. S. do L.; ROCHA, E. S. da. Dinâmica das áreas de reflorestamento no município de Paragominas, Estado do Pará, considerando dados temporais do projeto TerraClass. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE SENSORIAMENTO REMOTO, 18., 2017, Santos. Anais... São José dos Campos: INPE, 2017. p. 6694-6701.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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9. | | ADAMI, M.; GOMES, A. R.; BELUZZO, A.; COELHO, A. dos S.; VALERIANO, D. de M.; RAMOS, F. de S.; NARVAES, I. da S.; BROWN, I. F.; OLIVEIRA, I. D. de; SANTOS, L. B.; MAURANO, L. E. P.; WATRIN, O. dos S.; GRAÇA, P. M. L. de A. A confiabilidade do PRODES: estimativa da acurácia do mapeamento do desmatamento no estado Mato Grosso. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE SENSORIAMENTO REMOTO, 18., 2017, Santos. Anais... São José dos Campos: INPE, 2017. p. 4189-4196.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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10. | | SCARAMUZZA, C. A. de M.; SANO, E. E.; ADAMI, M.; BOLFE, E. L.; COUTINHO, A. C.; ESQUERDO, J. C. D. M.; MAURANO, L. E. P.; NARVAES, I. da S.; OLIVEIRA FILHO, F. J. B. de; ROSA, R.; SILVA, E. B. da; VALERIANO, D. de M.; VICTORIA, D. de C.; BAYMA, A. P.; OLIVEIRA, G. H. de; SILVA, G. B. S. da. Land-use and land-cover mapping of the Brazilian cerrado based mainly on Landsat-8 satellite images. Revista Brasileira de Cartografia, Rio de Janeiro, v. 69, n. 6, p. 1041-1051, jun. 2017. Título em português: Mapeamento de uso e cobertura de terras do cerrado com base principalmente em imagens do satélite Landsat-8.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Cerrados; Embrapa Territorial; Embrapa Unidades Centrais. |
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11. | | CORDEIRO, T. F.; NARVAES, I. da S.; BUCHMANN, H. M.; FREITAS, L. J. M. de; SAMPAIO, S. M. N.; MAIA, J. S.; ADAMI, M.; VALERIANO, D. de M.; GOMES, A. R.; BRIENZA JUNIOR, S.; OLIVEIRA, R. R. S. de; LOPES, M. G. Feições de exploração florestal de impacto reduzido na Flona do Tapajós utilizando imagens Landsat e filtros texturais. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE SENSORIAMENTO REMOTO, 18., 2017, Santos. Anais... São José dos Campos: INPE, 2017. p. 4859-4865.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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12. | | SANO, E. E.; ROSA, R.; SCARAMUZZA, C. A. de M.; ADAMI, M.; BOLFE, E. L.; COUTINHO, A. C.; ESQUERDO, J. C. D. M.; MAURANO, L. E. P.; NARVAES, I. da S.; OLIVEIRA FILHO, F. J. B. de; SILVA, E. B. da; VICTORIA, D. de C.; FERREIRA, L. G.; BRITO, J. L. S.; BAYMA, A. P.; OLIVEIRA, G. H. de O.; SILVA, G. B. S. da. Land use dynamics in the Brazilian Cerrado in the period from 2002 to 2013. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 54, e00138, 2019. Título em português: Dinâmica do uso das terras no Cerrado no período de 2002 a 2013.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital; Embrapa Cerrados; Embrapa Meio Ambiente; Embrapa Unidades Centrais. |
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